Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPIAP49247 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPIAP49247 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPIAP49247 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPIAP49247 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPIAP49247 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPIAP49247 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPIAP49247 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPIAP49247 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPIAP49247 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPIAP49247 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPIAP49247 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPIAP49247 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPIAP49247 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPIAP49247 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPIAP49247 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPIAP49247 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPIAP49247 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPIAP49247 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPIAP49247 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPIAP49247 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPIAP49247 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPIAP49247 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPIAP49247 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPIAP49247 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPIAP49247 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPIAP49247 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPIAP49247 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPIAP49247 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPIAP49247 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPIAP49247 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPIAP49247 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPIAP49247 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPIAP49247 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPIAP49247 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPIAP49247 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPIAP49247 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPIAP49247 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPIAP49247 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPIAP49247 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPIAP49247 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPIAP49247 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPIAP49247 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPIAP49247 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPIAP49247 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPIAP49247 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPIAP49247 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPIAP49247 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPIAP49247 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPIAP49247 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPIAP49247 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPIAP49247 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPIAP49247 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPIAP49247 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPIAP49247 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPIAP49247 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPIAP49247 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPIAP49247 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPIAP49247 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPIAP49247 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPIAP49247 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPIAP49247 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPIAP49247 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPIAP49247 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPIAP49247 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPIAP49247 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPIAP49247 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPIAP49247 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPIAP49247 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPIAP49247 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPIAP49247 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPIAP49247 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPIAP49247 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPIAP49247 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms