Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT6CP48668 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT6CP48668 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT6CP48668 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms