Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYKP43405 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYKP43405 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYKP43405 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYKP43405 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYKP43405 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYKP43405 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYKP43405 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYKP43405 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYKP43405 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYKP43405 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYKP43405 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYKP43405 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYKP43405 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYKP43405 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYKP43405 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYKP43405 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYKP43405 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYKP43405 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYKP43405 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYKP43405 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYKP43405 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYKP43405 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYKP43405 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYKP43405 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYKP43405 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYKP43405 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYKP43405 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYKP43405 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYKP43405 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYKP43405 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYKP43405 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYKP43405 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYKP43405 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYKP43405 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYKP43405 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYKP43405 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYKP43405 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYKP43405 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYKP43405 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYKP43405 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYKP43405 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYKP43405 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYKP43405 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYKP43405 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYKP43405 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYKP43405 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYKP43405 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYKP43405 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYKP43405 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYKP43405 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYKP43405 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYKP43405 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYKP43405 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYKP43405 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYKP43405 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYKP43405 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYKP43405 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYKP43405 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms