Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 TUB2YFL037W 1374 nt7.21□□□□□ -1.26
PDR11P40550 SPC34YKR037C 888 nt7.2□□□□□ -1.26
PDR11P40550 CEF1YMR213W 1773 nt7.2□□□□□ -1.26
PDR11P40550 QRI1YDL103C 1434 nt7.2□□□□□ -1.26
PDR11P40550 YFL042CYFL042C 2025 nt7.19□□□□□ -1.26
PDR11P40550 YBL044WYBL044W 369 nt7.19□□□□□ -1.26
PDR11P40550 RPL21BYPL079W 483 nt7.19□□□□□ -1.26
PDR11P40550 NHP6BYBR089C-A 300 nt7.19□□□□□ -1.26
PDR11P40550 TDA6YPR157W 1404 nt7.19□□□□□ -1.26
PDR11P40550 YMR111CYMR111C 1389 nt7.18□□□□□ -1.26
PDR11P40550 KEX2YNL238W 2445 nt7.18□□□□□ -1.26
PDR11P40550 VPS1YKR001C 2115 nt7.18□□□□□ -1.26
PDR11P40550 NOP8YOL144W 1455 nt7.18□□□□□ -1.26
PDR11P40550 FAU1YER183C 636 nt7.18□□□□□ -1.26
PDR11P40550 RPL7AYGL076C 735 nt7.18□□□□□ -1.26
PDR11P40550 RPL7BYPL198W 735 nt7.18□□□□□ -1.26
PDR11P40550 GAL10YBR019C 2100 nt7.17□□□□□ -1.26
PDR11P40550 HXT3YDR345C 1704 nt7.17□□□□□ -1.26
PDR11P40550 RRT2YBR246W 1164 nt7.17□□□□□ -1.26
PDR11P40550 PDH1YPR002W 1551 nt7.16□□□□□ -1.26
PDR11P40550 GCS1YDL226C 1059 nt7.16□□□□□ -1.26
PDR11P40550 THI4YGR144W 981 nt7.16□□□□□ -1.26
PDR11P40550 PXR1YGR280C 816 nt7.16□□□□□ -1.26
PDR11P40550 PSH1YOL054W 1221 nt7.16□□□□□ -1.26
PDR11P40550 YPS7YDR349C 1791 nt7.15□□□□□ -1.26
PDR11P40550 UTP18YJL069C 1785 nt7.15□□□□□ -1.26
PDR11P40550 VAM7YGL212W 951 nt7.15□□□□□ -1.27
PDR11P40550 GEX1YCL073C 1848 nt7.14□□□□□ -1.27
PDR11P40550 GEX2YKR106W 1848 nt7.14□□□□□ -1.27
PDR11P40550 YPT32YGL210W 669 nt7.14□□□□□ -1.27
PDR11P40550 PFA3YNL326C 1011 nt7.14□□□□□ -1.27
PDR11P40550 RAP1YNL216W 2484 nt7.14□□□□□ -1.27
PDR11P40550 ACO1YLR304C 2337 nt7.12□□□□□ -1.27
PDR11P40550 RPT4YOR259C 1314 nt7.12□□□□□ -1.27
PDR11P40550 RIO1YOR119C 1455 nt7.12□□□□□ -1.27
PDR11P40550 AVT3YKL146W 2079 nt7.11□□□□□ -1.27
PDR11P40550 DRN1YGR093W 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
PDR11P40550 UBA3YPR066W 900 nt7.11□□□□□ -1.27
PDR11P40550 YPR098CYPR098C 486 nt7.11□□□□□ -1.27
PDR11P40550 QDR1YIL120W 1692 nt7.11□□□□□ -1.27
PDR11P40550 SEC12YNR026C 1416 nt7.11□□□□□ -1.27
PDR11P40550 HFI1YPL254W 1467 nt7.1□□□□□ -1.27
PDR11P40550 VMA2YBR127C 1554 nt7.1□□□□□ -1.27
PDR11P40550 LCP5YER127W 1074 nt7.1□□□□□ -1.27
PDR11P40550 MRL1YPR079W 1146 nt7.1□□□□□ -1.27
PDR11P40550 VMA13YPR036W 1437 nt7.09□□□□□ -1.27
PDR11P40550 RSC4YKR008W 1878 nt7.09□□□□□ -1.27
PDR11P40550 ATG20YDL113C 1923 nt7.09□□□□□ -1.27
PDR11P40550 RPP0YLR340W 939 nt7.09□□□□□ -1.28
PDR11P40550 SCT1YBL011W 2280 nt7.09□□□□□ -1.28
PDR11P40550 AIM10YER087W 1731 nt7.08□□□□□ -1.28
PDR11P40550 CHO1YER026C 831 nt7.08□□□□□ -1.28
PDR11P40550 PGA2YNL149C 390 nt7.08□□□□□ -1.28
PDR11P40550 NUP116YMR047C 3342 nt7.07□□□□□ -1.28
PDR11P40550 YIL067CYIL067C 2037 nt7.07□□□□□ -1.28
PDR11P40550 ERG12YMR208W 1332 nt7.07□□□□□ -1.28
PDR11P40550 CAB4YGR277C 918 nt7.07□□□□□ -1.28
PDR11P40550 RPS19BYNL302C 435 nt7.07□□□□□ -1.28
PDR11P40550 GPM3YOL056W 912 nt7.07□□□□□ -1.28
PDR11P40550 WTM1YOR230W 1314 nt7.06□□□□□ -1.28
PDR11P40550 ADE4YMR300C 1533 nt7.05□□□□□ -1.28
PDR11P40550 SIP2YGL208W 1248 nt7.05□□□□□ -1.28
PDR11P40550 BUD8YLR353W 1812 nt7.04□□□□□ -1.28
PDR11P40550 SMF3YLR034C 1422 nt7.04□□□□□ -1.28
PDR11P40550 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt7.03□□□□□ -1.28
PDR11P40550 SCO1YBR037C 888 nt7.03□□□□□ -1.28
PDR11P40550 YNG2YHR090C 849 nt7.02□□□□□ -1.29
PDR11P40550 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt7.02□□□□□ -1.29
PDR11P40550 YJL220WYJL220W 453 nt7.02□□□□□ -1.29
PDR11P40550 LEM3YNL323W 1245 nt7.02□□□□□ -1.29
PDR11P40550 KIP2YPL155C 2121 nt7.02□□□□□ -1.29
PDR11P40550 PRS1YKL181W 1284 nt7.01□□□□□ -1.29
PDR11P40550 PEX22YAL055W 543 nt7.01□□□□□ -1.29
PDR11P40550 RHO2YNL090W 579 nt7.01□□□□□ -1.29
PDR11P40550 RGD1YBR260C 2001 nt7.01□□□□□ -1.29
PDR11P40550 NOT3YIL038C 2511 nt7.01□□□□□ -1.29
PDR11P40550 NOG2YNR053C 1461 nt7.01□□□□□ -1.29
PDR11P40550 YDR053WYDR053W 396 nt7.01□□□□□ -1.29
PDR11P40550 SER33YIL074C 1410 nt7□□□□□ -1.29
PDR11P40550 YFL034WYFL034W 3222 nt7□□□□□ -1.29
PDR11P40550 CLB2YPR119W 1476 nt7□□□□□ -1.29
PDR11P40550 PRR1YKL116C 1557 nt7□□□□□ -1.29
PDR11P40550 NHP6AYPR052C 282 nt7□□□□□ -1.29
PDR11P40550 HAS1YMR290C 1518 nt6.99□□□□□ -1.29
PDR11P40550 NQM1YGR043C 1002 nt6.99□□□□□ -1.29
PDR11P40550 VPS29YHR012W 849 nt6.99□□□□□ -1.29
PDR11P40550 HMS2YJR147W 1077 nt6.99□□□□□ -1.29
PDR11P40550 KTI12YKL110C 942 nt6.99□□□□□ -1.29
PDR11P40550 CKB2YOR039W 777 nt6.99□□□□□ -1.29
PDR11P40550 MTC5YDR128W 3447 nt6.98□□□□□ -1.29
PDR11P40550 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt6.98□□□□□ -1.29
PDR11P40550 NAG1YGR031C-A 492 nt6.98□□□□□ -1.29
PDR11P40550 MVD1YNR043W 1191 nt6.98□□□□□ -1.29
PDR11P40550 SRV2YNL138W 1581 nt6.98□□□□□ -1.29
PDR11P40550 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt6.97□□□□□ -1.29
PDR11P40550 YML057C-AYML057C-A 390 nt6.97□□□□□ -1.29
PDR11P40550 ECM3YOR092W 1842 nt6.97□□□□□ -1.29
PDR11P40550 ATM1YMR301C 2073 nt6.97□□□□□ -1.29
PDR11P40550 YMR027WYMR027W 1413 nt6.96□□□□□ -1.29
PDR11P40550 MCH4YOL119C 1506 nt6.96□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63 ms