Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIPAP38571 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPAP38571 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPAP38571 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPAP38571 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIPAP38571 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIPAP38571 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPAP38571 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LIPAP38571 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPAP38571 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LIPAP38571 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPAP38571 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPAP38571 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIPAP38571 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPAP38571 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPAP38571 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPAP38571 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIPAP38571 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPAP38571 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIPAP38571 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPAP38571 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPAP38571 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPAP38571 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPAP38571 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPAP38571 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPAP38571 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPAP38571 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPAP38571 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPAP38571 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPAP38571 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPAP38571 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPAP38571 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LIPAP38571 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LIPAP38571 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPAP38571 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPAP38571 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPAP38571 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPAP38571 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPAP38571 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms