Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL4P36578 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL4P36578 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL4P36578 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL4P36578 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL4P36578 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL4P36578 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL4P36578 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL4P36578 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL4P36578 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL4P36578 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL4P36578 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL4P36578 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL4P36578 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL4P36578 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL4P36578 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL4P36578 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL4P36578 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL4P36578 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL4P36578 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL4P36578 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL4P36578 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL4P36578 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL4P36578 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL4P36578 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL4P36578 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL4P36578 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL4P36578 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL4P36578 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL4P36578 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL4P36578 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL4P36578 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL4P36578 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL4P36578 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL4P36578 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL4P36578 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL4P36578 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL4P36578 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL4P36578 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL4P36578 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL4P36578 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL4P36578 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL4P36578 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL4P36578 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms