Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM23P36406 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM23P36406 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms