Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN2P35609 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN2P35609 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms