Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RYKP34925 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RYKP34925 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RYKP34925 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RYKP34925 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RYKP34925 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RYKP34925 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RYKP34925 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RYKP34925 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RYKP34925 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RYKP34925 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RYKP34925 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RYKP34925 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RYKP34925 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RYKP34925 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RYKP34925 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RYKP34925 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RYKP34925 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RYKP34925 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RYKP34925 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RYKP34925 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RYKP34925 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RYKP34925 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RYKP34925 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RYKP34925 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RYKP34925 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RYKP34925 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RYKP34925 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RYKP34925 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RYKP34925 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RYKP34925 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RYKP34925 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RYKP34925 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RYKP34925 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RYKP34925 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RYKP34925 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RYKP34925 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RYKP34925 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RYKP34925 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RYKP34925 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RYKP34925 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RYKP34925 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RYKP34925 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RYKP34925 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RYKP34925 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RYKP34925 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RYKP34925 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RYKP34925 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RYKP34925 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RYKP34925 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RYKP34925 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RYKP34925 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RYKP34925 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RYKP34925 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RYKP34925 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RYKP34925 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RYKP34925 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RYKP34925 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RYKP34925 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RYKP34925 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RYKP34925 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RYKP34925 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms