Protein–RNA interactions for Protein: P34223

SHP1, UBX domain-containing protein 1, yeast

Predictions only

Length 423 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHP1	P34223	CYC8	YBR112C	2901 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	IES1	YFL013C	2079 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	CHS5	YLR330W	2016 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	CEF1	YMR213W	1773 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	THI4	YGR144W	981 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	DED81	YHR019C	1665 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	NMT1	YLR195C	1368 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	PRP45	YAL032C	1140 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	YPR195C	YPR195C	330 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	YIL055C	YIL055C	1884 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	EFT2	YDR385W	2529 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	EFT1	YOR133W	2529 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	SPT3	YDR392W	1014 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	YNL296W	YNL296W	315 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	TFC6	YDR362C	2019 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	PSY4	YBL046W	1326 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	GUA1	YMR217W	1578 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	ATP1	YBL099W	1638 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	CBF1	YJR060W	1056 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	PPR1	YLR014C	2715 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	GYP1	YOR070C	1914 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	ACS1	YAL054C	2142 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	KNS1	YLL019C	2214 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	CMR1	YDL156W	1569 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	COX9	YDL067C	180 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	UTR4	YEL038W	684 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	ECM15	YBL001C	315 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	PAT1	YCR077C	2391 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SHP1	P34223	YFL034W	YFL034W	3222 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	STB5	YHR178W	2232 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	GPT2	YKR067W	2232 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	YFL052W	YFL052W	1398 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	HGH1	YGR187C	1185 nt		5.88	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	BUD28	YLR062C	378 nt		5.88	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	YML6	YML025C	861 nt		5.88	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	YDR514C	YDR514C	1452 nt		5.88	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	MKK1	YOR231W	1527 nt		5.88	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	COT1	YOR316C	1320 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	ENT2	YLR206W	1842 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	BAP2	YBR068C	1830 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	RPL7A	YGL076C	735 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	SCW4	YGR279C	1161 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	YIL060W	YIL060W	435 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	RPL7B	YPL198W	735 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	VPS5	YOR069W	2028 nt		5.86	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	VHT1	YGR065C	1782 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	YDR541C	YDR541C	1035 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	FZF1	YGL254W	900 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	ROX3	YBL093C	663 nt		5.85	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	ATG33	YLR356W	594 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	REG2	YBR050C	1017 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	NSE5	YML023C	1671 nt		5.84	□□□□□ -1.47
SHP1	P34223	RAP1	YNL216W	2484 nt		5.84	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	OPT1	YJL212C	2400 nt		5.84	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	RIO1	YOR119C	1455 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	TRP5	YGL026C	2124 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	RPN12	YFR052W	825 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	MTQ1	YNL063W	945 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	YBR016W	YBR016W	387 nt		5.83	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	YAP1	YML007W	1953 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	DRS1	YLL008W	2259 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	IDP1	YDL066W	1287 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	MTQ2	YDR140W	666 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	JAC1	YGL018C	555 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	COS6	YGR295C	1146 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	RPB4	YJL140W	666 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	SSK1	YLR006C	2139 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	MRPL4	YLR439W	960 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	PRE7	YBL041W	726 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	HXT15	YDL245C	1704 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	HXT16	YJR158W	1704 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	CLB1	YGR108W	1416 nt		5.82	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	PPM1	YDR435C	987 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	CWC21	YDR482C	408 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	YIL077C	YIL077C	963 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	OAC1	YKL120W	975 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	YOL131W	YOL131W	327 nt		5.8	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	MNN10	YDR245W	1182 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	COQ6	YGR255C	1440 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	FET3	YMR058W	1911 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.79	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	DPB2	YPR175W	2070 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	YFL042C	YFL042C	2025 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	YHR140W	YHR140W	720 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	RSA4	YCR072C	1548 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	ULA1	YPL003W	1389 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHP1	P34223	KTR5	YNL029C	1569 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	HSF1	YGL073W	2502 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	YLR317W	YLR317W	435 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	YBL070C	YBL070C	321 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	MSH1	YHR120W	2880 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	TUB2	YFL037W	1374 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	HRP1	YOL123W	1605 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	GAL10	YBR019C	2100 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	SKN1	YGR143W	2316 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	YEL020C	YEL020C	1683 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHP1	P34223	QRI1	YDL103C	1434 nt		5.76	□□□□□ -1.49

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