Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	NRM1	YNR009W	750 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	CAM1	YPL048W	1248 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	SRP101	YDR292C	1866 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	GAT1	YFL021W	1533 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	DDC1	YPL194W	1839 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	VNX1	YNL321W	2727 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	RGT1	YKL038W	3513 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YMR155W	YMR155W	1644 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	GSY2	YLR258W	2118 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	TRP1	YDR007W	675 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YJR115W	YJR115W	510 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	COX17	YLL009C	210 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	HCR1	YLR192C	798 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	RRT2	YBR246W	1164 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	UTP9	YHR196W	1728 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	PWP1	YLR196W	1731 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	ADE13	YLR359W	1449 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	EPS1	YIL005W	2106 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	BNA5	YLR231C	1362 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	NUD1	YOR373W	2556 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	YDL057W	YDL057W	987 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	CAD1	YDR423C	1230 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)C	tN(GUU)C	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)F	tN(GUU)F	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)G	tN(GUU)G	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)K	tN(GUU)K	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)L	tN(GUU)L	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)N1	tN(GUU)N1	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)N2	tN(GUU)N2	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)O1	tN(GUU)O1	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)O2	tN(GUU)O2	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	tN(GUU)P	tN(GUU)P	74 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	MPM1	YJL066C	759 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	SSK1	YLR006C	2139 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	PUS5	YLR165C	765 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	SEC13	YLR208W	894 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	RRN3	YKL125W	1884 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	TIM54	YJL054W	1437 nt		4.53	□□□□□ -1.68
VMA11	P32842	MNN2	YBR015C	1794 nt		4.53	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	PYC1	YGL062W	3537 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	RIM101	YHL027W	1878 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	BUL1	YMR275C	2931 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	RPL7A	YGL076C	735 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YGR182C	YGR182C	354 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	LDB18	YLL049W	540 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	ERI1	YPL096C-A	207 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	RPL7B	YPL198W	735 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YCL041C	YCL041C	495 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	RAD53	YPL153C	2466 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	MCX1	YBR227C	1563 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	DEF1	YKL054C	2217 nt		4.52	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	PHM8	YER037W	966 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	VAM7	YGL212W	951 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YKL151C	YKL151C	1014 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	COS9	YKL219W	1224 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	PNP1	YLR209C	936 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	PGA3	YML125C	939 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YOL097W-A	YOL097W-A	186 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	VMA4	YOR332W	702 nt		4.51	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YDL034W	YDL034W	345 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SNZ3	YFL059W	897 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	PRM10	YJL108C	1152 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YLL059C	YLL059C	507 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	ERG3	YLR056W	1098 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SNZ2	YNL333W	897 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	ENV9	YOR246C	993 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	NHP6B	YBR089C-A	300 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SMF2	YHR050W	1650 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	VTC2	YFL004W	2487 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YNL095C	YNL095C	1929 nt		4.5	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SIT1	YEL065W	1887 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	CYK3	YDL117W	2658 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SHE10	YGL228W	1734 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	VPS4	YPR173C	1314 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YGL194C-A	YGL194C-A	243 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SEC17	YBL050W	879 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	HSP26	YBR072W	645 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	TRK2	YKR050W	2670 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	EXO1	YOR033C	2109 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SIP5	YMR140W	1470 nt		4.49	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	APN1	YKL114C	1104 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	PDB1	YBR221C	1101 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	STL1	YDR536W	1710 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	NOB1	YOR056C	1380 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YGL036W	YGL036W	2730 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	TRP3	YKL211C	1455 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	OCA5	YHL029C	2040 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	DBF4	YDR052C	2115 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	CCZ1	YBR131W	2115 nt		4.48	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	ATG7	YHR171W	1893 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	UGO1	YDR470C	1509 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	MID1	YNL291C	1647 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YDR401W	YDR401W	564 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SLO1	YER180C-A	258 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	RPT6	YGL048C	1218 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	DBP8	YHR169W	1296 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YNL165W	YNL165W	1221 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	YPL062W	YPL062W	405 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	CBC2	YPL178W	627 nt		4.47	□□□□□ -1.69
VMA11	P32842	SSO1	YPL232W	873 nt		4.47	□□□□□ -1.69

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