Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRS3P32247 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRS3P32247 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRS3P32247 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRS3P32247 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRS3P32247 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRS3P32247 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRS3P32247 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRS3P32247 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BRS3P32247 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRS3P32247 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRS3P32247 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRS3P32247 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRS3P32247 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRS3P32247 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRS3P32247 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRS3P32247 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRS3P32247 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRS3P32247 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRS3P32247 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRS3P32247 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRS3P32247 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRS3P32247 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BRS3P32247 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRS3P32247 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRS3P32247 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRS3P32247 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRS3P32247 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRS3P32247 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRS3P32247 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRS3P32247 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRS3P32247 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRS3P32247 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRS3P32247 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRS3P32247 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRS3P32247 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms