Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL4A5P29400 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A5P29400 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL4A5P29400 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms