Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLD1P28340 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLD1P28340 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLD1P28340 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD1P28340 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD1P28340 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD1P28340 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD1P28340 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD1P28340 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD1P28340 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD1P28340 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD1P28340 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD1P28340 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD1P28340 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD1P28340 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD1P28340 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD1P28340 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD1P28340 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD1P28340 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD1P28340 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD1P28340 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD1P28340 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD1P28340 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD1P28340 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD1P28340 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLD1P28340 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLD1P28340 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLD1P28340 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLD1P28340 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
POLD1P28340 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLD1P28340 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLD1P28340 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLD1P28340 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLD1P28340 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
POLD1P28340 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLD1P28340 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD1P28340 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLD1P28340 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLD1P28340 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLD1P28340 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLD1P28340 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLD1P28340 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLD1P28340 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLD1P28340 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLD1P28340 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLD1P28340 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLD1P28340 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLD1P28340 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
POLD1P28340 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLD1P28340 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLD1P28340 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLD1P28340 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLD1P28340 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLD1P28340 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLD1P28340 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLD1P28340 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLD1P28340 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLD1P28340 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLD1P28340 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLD1P28340 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
POLD1P28340 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLD1P28340 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLD1P28340 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLD1P28340 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLD1P28340 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLD1P28340 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLD1P28340 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLD1P28340 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLD1P28340 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLD1P28340 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLD1P28340 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLD1P28340 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms