Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTSSP25774 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSSP25774 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSSP25774 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSSP25774 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSSP25774 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSSP25774 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTSSP25774 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSSP25774 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSSP25774 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSSP25774 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSSP25774 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSSP25774 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSSP25774 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSSP25774 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTSSP25774 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTSSP25774 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSSP25774 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTSSP25774 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTSSP25774 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTSSP25774 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSSP25774 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSSP25774 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSSP25774 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSSP25774 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSSP25774 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSSP25774 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSSP25774 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTSSP25774 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTSSP25774 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTSSP25774 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTSSP25774 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTSSP25774 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTSSP25774 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTSSP25774 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTSSP25774 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTSSP25774 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTSSP25774 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTSSP25774 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTSSP25774 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTSSP25774 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTSSP25774 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTSSP25774 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTSSP25774 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTSSP25774 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms