Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP11P24347 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP11P24347 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP11P24347 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP11P24347 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP11P24347 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP11P24347 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MMP11P24347 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP11P24347 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP11P24347 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP11P24347 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP11P24347 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP11P24347 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP11P24347 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP11P24347 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP11P24347 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP11P24347 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP11P24347 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP11P24347 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP11P24347 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP11P24347 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP11P24347 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP11P24347 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP11P24347 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP11P24347 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP11P24347 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP11P24347 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP11P24347 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP11P24347 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP11P24347 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP11P24347 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP11P24347 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP11P24347 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP11P24347 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP11P24347 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP11P24347 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP11P24347 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP11P24347 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP11P24347 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP11P24347 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP11P24347 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP11P24347 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP11P24347 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP11P24347 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP11P24347 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms