Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRDP23468 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRDP23468 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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