Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKACBP22694 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKACBP22694 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms