Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK11BP21127 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms