Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA1P20827 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms