Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP4AP20648 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms