Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB4AP20338 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB4AP20338 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms