Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHCEP18577 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHCEP18577 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHCEP18577 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHCEP18577 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHCEP18577 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHCEP18577 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHCEP18577 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHCEP18577 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHCEP18577 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHCEP18577 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHCEP18577 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHCEP18577 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHCEP18577 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHCEP18577 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHCEP18577 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHCEP18577 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHCEP18577 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHCEP18577 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHCEP18577 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHCEP18577 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHCEP18577 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHCEP18577 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHCEP18577 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHCEP18577 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHCEP18577 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHCEP18577 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHCEP18577 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHCEP18577 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHCEP18577 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHCEP18577 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHCEP18577 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHCEP18577 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHCEP18577 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHCEP18577 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RHCEP18577 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHCEP18577 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHCEP18577 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHCEP18577 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHCEP18577 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHCEP18577 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHCEP18577 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHCEP18577 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHCEP18577 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHCEP18577 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHCEP18577 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHCEP18577 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHCEP18577 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHCEP18577 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHCEP18577 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHCEP18577 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHCEP18577 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHCEP18577 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHCEP18577 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHCEP18577 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHCEP18577 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHCEP18577 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHCEP18577 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHCEP18577 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms