Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GM2AP17900 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GM2AP17900 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GM2AP17900 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GM2AP17900 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GM2AP17900 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GM2AP17900 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GM2AP17900 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GM2AP17900 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GM2AP17900 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GM2AP17900 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GM2AP17900 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GM2AP17900 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GM2AP17900 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GM2AP17900 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GM2AP17900 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GM2AP17900 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GM2AP17900 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GM2AP17900 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GM2AP17900 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GM2AP17900 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GM2AP17900 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GM2AP17900 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GM2AP17900 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GM2AP17900 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GM2AP17900 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GM2AP17900 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GM2AP17900 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GM2AP17900 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GM2AP17900 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GM2AP17900 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GM2AP17900 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms