Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF3P17036 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF3P17036 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF3P17036 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms