Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN1P12814 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN1P12814 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACTN1P12814 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms