Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP2P12643 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP2P12643 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP2P12643 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP2P12643 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP2P12643 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BMP2P12643 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP2P12643 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP2P12643 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP2P12643 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP2P12643 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP2P12643 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP2P12643 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP2P12643 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMP2P12643 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP2P12643 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP2P12643 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP2P12643 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP2P12643 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMP2P12643 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP2P12643 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP2P12643 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP2P12643 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP2P12643 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP2P12643 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP2P12643 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP2P12643 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BMP2P12643 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP2P12643 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP2P12643 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP2P12643 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP2P12643 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMP2P12643 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP2P12643 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP2P12643 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP2P12643 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP2P12643 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP2P12643 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP2P12643 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP2P12643 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BMP2P12643 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP2P12643 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP2P12643 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP2P12643 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP2P12643 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP2P12643 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP2P12643 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP2P12643 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP2P12643 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BMP2P12643 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BMP2P12643 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP2P12643 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP2P12643 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP2P12643 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP2P12643 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP2P12643 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP2P12643 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMP2P12643 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms