Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESRRAP11474 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESRRAP11474 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms