Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNHG28P0DPA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNHG28P0DPA3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNHG28P0DPA3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms