Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM225BP0DP42 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM225BP0DP42 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms