Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2BP0DMP2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP2BP0DMP2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRGAP2BP0DMP2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms