Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM18P0DKX4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM18P0DKX4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM18P0DKX4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM18P0DKX4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM18P0DKX4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM18P0DKX4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM18P0DKX4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms