Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RD3LP0DJH9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms