Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00032P0C843 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00032P0C843 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00032P0C843 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00032P0C843 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00032P0C843 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00032P0C843 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00032P0C843 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00032P0C843 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00032P0C843 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms