Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TNP1P09430 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
TNP1P09430 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TNP1P09430 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TNP1P09430 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TNP1P09430 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms