Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRCP08575 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRCP08575 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRCP08575 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
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