Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESR1P03372 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESR1P03372 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESR1P03372 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESR1P03372 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ESR1P03372 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESR1P03372 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESR1P03372 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ESR1P03372 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESR1P03372 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESR1P03372 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESR1P03372 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESR1P03372 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESR1P03372 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESR1P03372 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ESR1P03372 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ESR1P03372 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ESR1P03372 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESR1P03372 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESR1P03372 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESR1P03372 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ESR1P03372 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESR1P03372 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESR1P03372 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESR1P03372 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESR1P03372 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESR1P03372 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESR1P03372 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESR1P03372 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESR1P03372 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESR1P03372 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESR1P03372 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESR1P03372 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESR1P03372 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ESR1P03372 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESR1P03372 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms