Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGGP02679 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGGP02679 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FGGP02679 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGGP02679 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGGP02679 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGGP02679 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGGP02679 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGGP02679 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGGP02679 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGGP02679 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGGP02679 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGGP02679 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGGP02679 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGGP02679 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGGP02679 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGGP02679 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FGGP02679 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGGP02679 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGGP02679 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGGP02679 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGGP02679 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGGP02679 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGGP02679 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGGP02679 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGGP02679 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGGP02679 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGGP02679 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGGP02679 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGGP02679 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGGP02679 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGGP02679 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGGP02679 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGGP02679 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGGP02679 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGGP02679 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGGP02679 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGGP02679 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGGP02679 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGGP02679 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGGP02679 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGGP02679 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGGP02679 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGGP02679 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGGP02679 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGGP02679 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGGP02679 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGGP02679 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGGP02679 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGGP02679 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGGP02679 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGGP02679 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGGP02679 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGGP02679 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGGP02679 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGGP02679 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGGP02679 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGGP02679 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGGP02679 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGGP02679 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGGP02679 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms