Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYF2O95926 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYF2O95926 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYF2O95926 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYF2O95926 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYF2O95926 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYF2O95926 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYF2O95926 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SYF2O95926 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYF2O95926 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYF2O95926 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYF2O95926 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYF2O95926 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYF2O95926 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYF2O95926 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYF2O95926 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYF2O95926 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYF2O95926 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYF2O95926 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYF2O95926 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYF2O95926 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYF2O95926 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYF2O95926 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYF2O95926 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYF2O95926 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYF2O95926 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYF2O95926 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYF2O95926 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYF2O95926 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYF2O95926 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYF2O95926 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYF2O95926 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYF2O95926 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYF2O95926 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYF2O95926 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYF2O95926 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYF2O95926 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYF2O95926 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYF2O95926 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYF2O95926 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYF2O95926 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYF2O95926 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYF2O95926 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYF2O95926 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYF2O95926 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYF2O95926 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYF2O95926 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYF2O95926 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYF2O95926 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYF2O95926 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYF2O95926 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYF2O95926 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms