Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKRAO75569 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKRAO75569 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKRAO75569 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms