Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 INSIG2-202ENST00000411929 574 ntTSL 217.32■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ABCA2-204ENST00000398207 876 ntTSL 517.29■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.365e-8■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BCAS3-229ENST00000592702 2094 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 417.21■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CLSTN3-216ENST00000545663 533 ntTSL 417.21■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ABCA2-224ENST00000625103 371 ntTSL 317.15■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 417.14■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CLSTN3-213ENST00000541953 570 ntTSL 517.11■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-207ENST00000589802 434 ntTSL 317.07■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATG16L2-207ENST00000536995 4577 ntTSL 216.91■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 OXR1-204ENST00000438229 1436 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LIN37-204ENST00000590706 1372 ntTSL 216.82■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SOCS7-204ENST00000617765 480 ntTSL 516.81■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF205-204ENST00000444510 726 ntTSL 416.78■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SH3BGR-206ENST00000440288 585 ntTSL 516.77■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PGAP3-205ENST00000577337 587 ntTSL 316.75■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZC3H7A-213ENST00000575170 831 ntTSL 316.72■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BCAS3-205ENST00000585812 2214 ntTSL 216.69■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ADSSL1-203ENST00000553540 1791 ntTSL 216.67■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 VWA1-204ENST00000495558 819 ntTSL 216.67■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATG16L2-215ENST00000541367 1575 ntTSL 516.55■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-217ENST00000491659 648 ntTSL 316.54■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYO18A-204ENST00000528564 589 ntTSL 416.5■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 C15orf39-204ENST00000563905 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.49■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 GALNS-203ENST00000562593 5682 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MANBA-206ENST00000511813 628 ntTSL 416.38■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NDE1-203ENST00000570727 588 ntTSL 416.31■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAP3K14-AS1-206ENST00000588504 544 ntTSL 416.3■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZFP64-212ENST00000477786 909 ntTSL 516.28■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-211ENST00000592392 760 ntTSL 316.23■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZC3H7A-216ENST00000576018 575 ntTSL 416.21■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PLEKHM1-206ENST00000580404 2628 ntTSL 516.2■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 JARID2-203ENST00000474854 520 ntTSL 316.18■□□□□ 0.182e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AP003071.5-202ENST00000641280 500 nt16.17■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MUS81-212ENST00000530282 755 ntTSL 216.11■□□□□ 0.173e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC35B1-204ENST00000502406 1477 ntTSL 216.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ANKRD54-210ENST00000498417 2403 ntTSL 215.99■□□□□ 0.153e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.153e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PGAP3-202ENST00000309862 3028 ntTSL 215.91■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TTC28-AS1-210ENST00000430525 524 ntTSL 415.91■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NFYC-218ENST00000488635 1481 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-206ENST00000448971 610 ntTSL 315.86■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CELF5-206ENST00000588350 3115 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PSD4-206ENST00000460725 2763 ntTSL 215.77■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ARAP1-217ENST00000542612 428 ntTSL 515.75■□□□□ 0.112e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SWI5-202ENST00000372898 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.68■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MAEA-217ENST00000512842 550 ntTSL 415.6■□□□□ 0.092e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SOGA1-203ENST00000463491 802 ntTSL 215.59■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 KRT8-212ENST00000549198 592 ntTSL 215.56■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 KDM2B-214ENST00000542030 460 ntTSL 415.52■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MYO18A-216ENST00000533420 1168 ntTSL 515.48■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF205-205ENST00000570935 766 ntTSL 515.47■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ZNF571-AS1-208ENST00000590838 2511 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 DDX11-221ENST00000542661 562 ntTSL 515.41■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PPHLN1-210ENST00000547440 1898 ntTSL 215.39■□□□□ 0.053e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 RPS3A-202ENST00000503002 480 ntTSL 315.31■□□□□ 0.042e-17■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TMEM184B-212ENST00000633056 4792 nt15.19■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATG16L2-220ENST00000544490 3731 ntTSL 215.16■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 ATG16L2-213ENST00000540222 1400 ntTSL 515.14■□□□□ 0.013e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NPEPPS-218ENST00000532729 711 ntTSL 315.1■□□□□ 0.013e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NPEPPS-221ENST00000534691 548 ntTSL 515.1■□□□□ 0.013e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MCM10-203ENST00000459751 618 ntTSL 315.05■□□□□ -03e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PEPD-204ENST00000588328 581 ntTSL 315.04■□□□□ -03e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -03e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 SLC9A3R2-206ENST00000565086 685 ntTSL 315.03■□□□□ -01e-11■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PRR14L-202ENST00000330495 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.02□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 PGAP3-207ENST00000580898 556 ntTSL 415.01□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 LIN37-207ENST00000591163 532 ntTSL 514.96□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 NCEH1-201ENST00000421723 602 ntTSL 214.95□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC138894.1-212ENST00000637745 879 ntTSL 514.95□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 TMEM184B-213ENST00000633438 1369 ntTSL 514.95□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.93□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
SF3B1O75533 RAPGEF1-204ENST00000414781 957 ntTSL 514.92□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 206.8
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 289.2 ms