Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF21O75509 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF21O75509 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms