Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22BO75396 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22BO75396 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms