Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF3O75054 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGSF3O75054 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF3O75054 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF3O75054 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.3 ms