Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC22O60826 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC22O60826 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms