Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF10O60809 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF10O60809 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF10O60809 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms