Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH6O60337 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH6O60337 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH6O60337 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms