Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAK2O60296 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK2O60296 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK2O60296 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK2O60296 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK2O60296 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK2O60296 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK2O60296 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK2O60296 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK2O60296 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK2O60296 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK2O60296 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK2O60296 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK2O60296 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK2O60296 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK2O60296 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK2O60296 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK2O60296 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK2O60296 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK2O60296 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAK2O60296 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAK2O60296 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms