Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3O43617 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC3O43617 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3O43617 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms