Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSI1O43347 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSI1O43347 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSI1O43347 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSI1O43347 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSI1O43347 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSI1O43347 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSI1O43347 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSI1O43347 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MSI1O43347 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSI1O43347 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSI1O43347 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSI1O43347 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSI1O43347 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSI1O43347 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSI1O43347 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSI1O43347 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSI1O43347 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSI1O43347 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSI1O43347 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSI1O43347 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSI1O43347 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSI1O43347 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSI1O43347 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MSI1O43347 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSI1O43347 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSI1O43347 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSI1O43347 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSI1O43347 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSI1O43347 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSI1O43347 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSI1O43347 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSI1O43347 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSI1O43347 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSI1O43347 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSI1O43347 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSI1O43347 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSI1O43347 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSI1O43347 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSI1O43347 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSI1O43347 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSI1O43347 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MSI1O43347 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSI1O43347 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI1O43347 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI1O43347 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI1O43347 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI1O43347 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI1O43347 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI1O43347 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI1O43347 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSI1O43347 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSI1O43347 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSI1O43347 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms